O Curso de Doutorado em Alimentos, Nutrição e Saúde é gratuito, tem duração de 4 anos, e oferece 10 vagas anualmente para os alunos regulares. Além disso, são ofertadas vagas para alunos estrangeiros, cujo quantitativo é definido anualmente pelo Colegiado. O Doutorado em Alimentos, Nutrição e Saúde possui natureza acadêmica e tem como pré-requisito para a ingresso que o candidato possua nível de Mestre em qualquer área do conhecimento. As aulas são ministradas em período integral e concentradas no prédio da Escola de Nutrição da UFBA.
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